反激式开关电源的工作原理是MOS管导通时，原边绕组储存能量，MOS管关断时，原边绕组向副边绕组传递能量。
CCM模式时，传递的能量的大小为1/2*LP*IP2和1/2*LP*(IP-IR)2的差，也就是说下一次MOS开启时，原边绕组还有未传递完的能量，当然原边电流不为零了；另外电感的一个重要特性，电感两端电流不能突变，所以MOS管关断时，电流也不可能瞬间变为零。
以上纯属个人理解。
如果没有原边绕组的存在，就是你所说的“按道理MOS一关断原边电流就为零了”，呵
